En el marco de la causa N° 2637/04, caratulada “Vaello, Orestes y otros s/privación ilegal de la libertad agravada”, conexa a la principal, se investigan los hechos de privación ilegal de la libertad agravada, tormentos y homicidios acaecidos en el centro clandestino de detención conocido como "Automotores Orletti".

El 6 de septiembre de 2006, se resolvió decretar el procesamiento con prisión preventiva de Néstor Horacio Guillamondegui, Rubén Víctor Visuara, Eduardo Rodolfo Cabanillas, Honorio Carlos Martínez Ruiz y Raúl Antonio Guglielminetti, por 65 casos de privaciones ilegales de la libertad y tormentos acaecidos en dicho centro clandestino de detención.

En tanto, el 23 de noviembre de 2006 se dispuso decretar el procesamiento con prisión preventiva de Eduardo Alfredo Ruffo.

Los resolutivos reseñados fueron confirmados por la Sala I de la cámara del fuero. El 19 de julio de 2007, confirmó el auto de procesamiento que fuera dictado el 6 de septiembre de 2006, y el 16 de agosto de 2007 confirmó el procesamiento con prisión preventiva de Eduardo Alfredo Ruffo.

Consecuentemente, estimándose completa la instrucción de los hechos que fueran objeto de imputación a los nombrados, el juez ordenó el 4 de septiembre de 2008 la clausura parcial de la instrucción relativa a los hechos que sucedieran en el centro clandestino de detención “Automotores Orletti” y la elevación de las actuaciones; actualmente las mismas se encuentran radicadas ante el Tribunal Oral en lo Criminal Federal N° 2.

También revisten carácter de imputados ciudadanos uruguayos integrantes del Ejército de la República Oriental del Uruguay. A su respecto se encuentra en trámite los procesos de captura internacional y extradición, según los casos.